干旱是严重制约农艺生产的世界性问题,是限制农业生产最主要的非生物因素之一,是制约青稞产量的主要因素之一。近日,betway88必威东盟体育作物遗传育种学系冯宗云教授团队完成的最新研究成果“IGenome-wide association mapping of hulless barley phenotypes in drought environment”在国际主流学术刊物《Frontiers in Plant Science》(二区TOP期刊,IF=6.627)上发表,结果对青稞抗旱育种具有重要指导作用。
本研究以269份不同基因型青稞资源为材料,利用全基因组关联分析鉴定了与抗旱性状显著关联的SNP标记。供试材料在正常及干旱胁迫条件下,调查了地上部鲜重、地上部干重、地下部鲜重、地下部干重、叶片鲜重、叶片干重、地上部(苗)失水率、地下部(根)失水率、叶片含水量、叶片相对含水量、根/芽鲜重比率、根/芽干重比率等多种数量性状及主穗长、单株粒数、单株粒重、千粒重、主穗小穗数、株高、单株有效穗数等田间表型性状。基因型分型后,共获得8936130个高度一致的SNP,这些SNP的缺失率低于50%,最小等位基因频率大于0.05。在显著耐旱性位点附近,共获得8个对青稞抗旱性有潜在贡献的候选基因。
该研究以betway88必威东盟体育为第一署名单位,博士研究生李洁为第一作者,冯宗云教授为第一通讯作者。该研究受到国家重点研发计划(2018YFD1000705、2018YFD1000700)、国家自然科学基金(32060480)、国家现代农业产业技术体系(CARS-05)、四川省国际科技合作项目(2021YFH0113)及betway88必威东盟体育双支计划基金等资助。
全文链接:
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2022.924892
图1 SNP标记在染色体上的分布
图2基于GBS鉴定到的5949446个SNPs构建的269份青稞自然群体的进化树
图3多次实验中抗旱性状关联分析的曼哈顿图和Q-Q图(FaST-LMM)
a-b )单株有效穗数(ESNP), c )主穗数(MEN), d )主穗长(MSL), e )干重根冠比(RSWD), f )千粒重(TGW).